福建检验检疫局：福州、泉州、莆田、三明、龙岩、宁德、南平行政辖区，以及漳州的东山、诏安、云霄三县行政辖区

福州检验检疫局：除福清市、平潭县外的福州市行政辖区

泉州检验检疫局：除晋江市、石狮市外的泉州市行政辖区

莆田检验检疫局：莆田市行政辖区

福清检验检疫局：福清市及平潭县行政辖区

三明检验检疫局：三明市行政辖区

宁德检验检疫局：宁德市行政辖区

南平检验检疫局：除武夷山市、建阳市外的南平市行政辖区

龙岩检验检疫局：龙岩市行政辖区

东山检验检疫局：东山、诏安、云霄三县行政辖区

晋江检验检疫局：晋江市行政辖区

福建检验检疫局福州机场办事处：福州机场空港

福建检验检疫局石狮办事处：石狮市行政辖区

福建检验检疫局武夷山办事处：武夷山市、建阳市行政辖区

福建检验检疫局邮件办事处：福州邮件中心