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截至2008年1月，福建国检局已备案蔬菜基地271个，面积14.67万亩，备案食用菌基地102个，面积6039.43亩，备案茶叶基地269个，面积40.63万亩。据统计，福建国检局辖区有87个4.4万亩基地，分布在厦门局、河南局、浙江局、湖北局、云南局、江苏局、安徽局等14个直属局辖区；同时有浙江、厦门、江苏、江西等多个直属局20多万亩茶叶、食用菌、蔬菜备案基地需转移到福建局备案。
为确保辖区备案基地外移与内迁交接工作顺利进行，福建局重点抓好与直属局之间的交接工作，创新机制加强直属局之间协作和转换工作顺利进行：一是与浙江局、厦门局等直属局专门召开基地移交工作研讨会，通过面对面的交流协商基地移交工作中的存在问题，共同探讨解决问题方法；二是通过直属局之间签订协作协议或会议纪要，明确双方的移交方式和信息沟通机制，协调解决转换过程步调与具体措施落实问题；三是直接让不在同一辖区的出口加工企业、备案基地的负责人参与直属局之间的异地基地移交工作，通过四方面对面的交流共同解决转换过程的疑点与难点；四是建立直属局之间、及其直属局分支机构之间的信息沟通方式和机制，并拟建立联合考核、联合监管与联合实施残留监控等协作措施，探索建立异地备案基地、出口企业、备案基地所在地检验检疫与出口企业所在地检验检疫有效的产地联合监管模式。
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